《仙剑千年缘之缘来是缘》主题围绕着仙侠世界中的缘分展开。缘分在仙侠情境下是一种神秘而又强大的力量，它能让不同的人相遇，引发一段段故事。
在仙剑的世界里，缘是一种奇妙的连接。仙侠们求道修仙，四处游历。许多时候，在不经意间就会遇到某个人。或许是在幽静的山林，或许是在热闹集市，两人目光交汇的瞬间就产生奇妙反应。就像李逍遥和赵灵儿在仙灵岛的相遇，那是命运的开始。一个是懵懂的少年，一个是单纯的少女，他们被缘分牵扯到一起，开启了一段跌宕起伏的旅程。
缘来不止铸就爱情。友情也是仙剑中缘分的重要体现。那些行侠仗义之人，因为共同的目标走到一起。他们或许性格各异，有的豪爽，有的内敛。却能在面对强大敌手时并肩作战。像景天和他的伙伴们，因为宿命中要对抗邪剑仙而结伴同行。一路的扶持，友情在一次次患难与共中加深。这就是缘分安排下的友情，牢固且坚韧。
不过缘来的美好背后也有苦涩。在仙剑的故事中存在着许多因为缘分发生又因缘分失去的故事。